; 元万顷的话，点明了此次“御注”的核心意图：重新定义“王法”与“佛法”的关系，将“护国”提升为佛教（尤其是寺院和僧侣）的最高义务之一，从而为“限僧策”等一系列整顿措施提供最高层面的理论依据和合法性背书。 这不是简单的信仰行为，而是一次政治神学的建构。
二、 朱批御注，字字千钧
数日后，贞观殿（武则天日常处理政务之所）旁的暖阁内，灯火长明。武则天卸去了白日朝会的严妆，只着一身杏黄色常服，外罩一件绣有金丝莲纹的绡纱披帛，坐于御案之后。案上摊开的，正是用泥金书写在磁青笺上的《仁王护国般若波罗蜜多经》精写本。一旁堆着高僧与学士们整理好的资料摘要、历代注疏精华，以及数份草拟的注释初稿。
武则天并非仅仅做做样子。她早年于感业寺为尼的经历，使她具备相当的佛学素养。登基后，更是延请高僧入宫讲·法，对佛教义理，尤其是与她政治诉求相关的部分，颇有钻研。此刻，她手持朱笔，时而凝神细阅经文，时而翻阅参考资料，时而提笔在经文字句旁的空隙处，以端庄秀逸又隐含锋棱的楷书，写下自己的批注。
她的批注，并非完全遵循传统注疏的章句训诂，而是带有鲜明的个人色彩和政治指向。
在经文提及“若国王大臣，能持此经，恭敬供养，一切灾难皆悉消灭”处，她批注道：“此言王臣持经，非仅诵读供养之谓。王者，当以正法治国，明刑弼教，使邪伪不行，忠良得所，是谓持经。大臣，当辅佐明君，清心奉法，利济生民，是谓供养。如此，则国基永固，灾难自消，岂独鬼神呵护哉**？”
—— 将“持经”解释为“以正法治国”、“清心奉法”，将护国祛灾与良好的政治治理直接挂钩，淡化单纯宗教仪式的效用。
在提及“法师护国”部分时，她批注：“何谓法师护国？非谓僧徒干政，亦非空谈慈悲。当严守戒律，精进修行，以德行化导愚顽；当劝导信众，忠君爱国，完粮纳税；当以寺产之余，赈灾济困，修路铺桥，力行善举。如此，则僧伽清净，民受其惠，国蒙其福，是谓真护国。若不事生产，坐享厚利，甚而侵夺民田，影庇奸猾，则非但不能护国，实乃国之蠹虫，有违佛法本怀，天地鬼神所不容**。”
—— 明确界定僧侣的“护国”责任在于教化、劝善、慈善，并直接批评侵占民利的行为，将“限僧策”的核心诉求提升到“违背佛法”、“天地不容”的高度。
在论及“如来付嘱国王大臣，护持佛法”时，她写道：“如来付嘱，盖因王者代天牧民，有统御之权，调御之责。护持佛法，非为纵容僧伽恣意妄为，乃为令正法得行，邪伪不生。故王者有权，亦有其责，裁定僧尼额度，清查寺观田产，引导僧众 务本（忠于国家）、利生（利益百姓），使 佛法与王法相得益彰，共护 社稷苍生。此乃如来之本意，王者之天职。”
—— 这是最核心、最大胆的批注。她直接阐释“护持佛法”是君王的权力也是责任，这权力和责任就包括“裁定僧尼额度”、“清查寺观田产”、“引导僧众”，将世俗皇权对宗教的管理和整顿，定义为符合佛意的“天职”，从而在佛教理论内部，为皇权干预、规范宗教事务提供了至高无上的合法性。
字字朱批，力透纸背。每一处注解，都不仅仅是佛学义理的探讨，更是政治理念的宣言，是权
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